在生物學上，正是因為動植物的欺騙性外表，科學家才走了很多彎路。 在成熟的 DNA 技術出現(xiàn)之前，科學家通常依靠動植物的外觀及其解剖結構和習性來進行分類，這導致許多物種出現(xiàn)在錯誤的譜系上。 隨著DNA技術的發(fā)展，許多物種在生命之樹上的位置都得到了調(diào)整。

曾幾何時，人類所屬的靈長類動物被認為是蝙蝠的近親，因為靈長類動物的骨骼和大腦與蝙蝠有一些相似之處。 然而，DNA 數(shù)據(jù)現(xiàn)在將我們置于一個包括嚙齒動物和兔子的組中。 令人驚訝的是，蝙蝠與牛、馬甚至犀牛的關系比與我們的關系更密切。在達爾文時代和 20 世紀的大部分時間里，科學家們只能通過觀察植物和動物的結構和外觀來繪制生命進化樹的分支，根據(jù)被認為共同進化的相似性對生命形式進行分組。

大約三十年前，科學家們開始利用 DNA 數(shù)據(jù)在分子水平上構建新的生命之樹。 基于DNA數(shù)據(jù)的生命之樹與經(jīng)典的生命之樹有很大不同。 在經(jīng)典的生命之樹上，樹懶和食蟻獸、犰狳、穿山甲，因為它們具有相同的解剖學學術特征。 新的生命樹表明，這些特征在哺乳動物生命樹的不同分支中獨立進化——趨同進化。 事實證明，土豚與大象的關系更為密切，而穿山甲與貓和狗的關系更為密切。

達爾文和他的同時代人熟悉分類的另一個重要基礎。 達爾文指出，似乎擁有最接近共同祖先的動植物往往在地理上更接近。 物種的位置是它們相互聯(lián)系的另一個強有力的指標：生活在地理上接近的物種更有可能共享一個家譜。在一項新的研究中，科學家們首次交叉引用了一系列動植物的位置、DNA數(shù)據(jù)和外觀，檢查了包括蝙蝠、狗、猴子、 蜥蜴和松樹。 與傳統(tǒng)的進化圖相比，基于 DNA 數(shù)據(jù)的生命進化樹更可能匹配物種的位置。 研究表明，與通過 DNA 數(shù)據(jù)關聯(lián)的物種相比，物種彼此靠近的可能性要小得多。