元代到明代前期，回回人中包含有信仰伊斯蘭教的回紇(回鶻)人的后裔，他們同當時高昌及河西一帶仍信仰佛教的畏兀兒人相區(qū)別，明中葉以后，維吾爾族普遍接受伊斯蘭教信仰，而當維吾爾人遷到內地之后，自然地漸漸同化于回回之中。

元、明以來，不少蒙古貴族及其士卒因接受伊斯蘭教信仰而逐漸同化于回回之中。明代哈密地區(qū)的哈剌灰人，原是蒙古人，正德(1506～1521)以后由哈密遷到肅州，到萬歷年間已經(jīng)“不食豬肉，與回回同俗”。另外，由于通婚的和政治的原因，以及接受宗教信仰和風俗習慣的原因，回回中不斷吸收了相當多的漢族成分。由于同樣原因也有不少回回逐漸同化于漢族之中。

回族與維吾爾、蒙古、漢等族有著源遠流長的親緣關系。另外，回回族中還吸收有中國猶太人成份。猶太人遷居我國開封等地的時間，一般認為在北宋徽宗年間(1101一1125)。元代稱他們?yōu)椤靶g忽回回”。由于他們信仰猶太教，不食豬肉，行割禮和每日禮拜等宗教習俗與回回有相似之處，加上舉行宗教儀式時所纏頭巾為青藍色，因而也被稱為“藍帽回回”或“青回回”。在長期發(fā)展中，有的逐漸融合于回回當中，有的自稱回回。

從元代到明代，各種不同的來源的回回逐漸形成為一個新的民族。伴隨著民族的形成，具有本民族特點的回回文化扎根于華夏大地，成為華夏文化中的一個新類型。